微生物组学分析研讨班

背      景:

近年来,微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用,成为了上述领域必不可少的研究技术。在此,北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。

专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值,为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加!


主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司

举办地点:
北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间:
2018.11.28-30(报名中)本次课程时间: 上午:9:30-12:00下午:13:30-17:00
培训内容:
 

日期

授课题目

授课内容

第一天

上午

微生物组学研究的发展和挑战

1、微生物组研究的发展历史

2、测序平台介绍

3、基于测序的研究方法

3.1 宏基因组(target sequencing 和全基因组)

3.2 单个微生物de novo测序

4、应用案例分析

第一天

下午

target   sequencing数据分析

1、linux常用命令使用和上机操作

2、数据分析过程中的编程简介(perl、R、python等)

3、target sequencing数据分析加上机

3.1质控

3.2去嵌合体

3.3 OTU聚类

3.4 注释

3.5统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。

第二天

全天

Whole   metagenome 和metatranscriptome数据分析

1、质控

2、拼接组装:SOAPdenovo;MetaVelvet; Meta-IDBA等

3、聚类Binning:TETRA;   MetaCluster; Phymm等

4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等

5、功能注释:RAMMCAP;Blast等

6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)表达分析

第三天

全天

 

微生物de novo测序分析

1 质控

2 单细胞测序去污染、去嵌合体等

3、拼接组装:SPAdes等

4、基因预测

5、功能注释

6、代谢途径分析

7、进化分析:(1)SNP;(2)插入缺失(3)水平基因转移;

8、转录组分析:(1)基因差异表达分析;(2)代谢通路分析

(课程内容以实际授课为准)


报名费用:

注册费:4000元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。


付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)


报名优惠活动:

   1、11.1日前报名并缴费的学员每人可优惠200元; 

   23人以上团体报名每人可减少300元;

   3、 4+1团报,可免费赠送一个名额;               

   4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。


报名表
单位名称:报名课程:开课时间:sxxx
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