分子模拟与蛋白互作研习班通知

背      景:

 蛋白质组学是研究生命科学现象与科学规律的重要途径,在各个研究领域都有广泛应用。有许多蛋白质相关的数据库资源及生物信息学

分析工具,在研究蛋白质的鉴定、结构分析与模拟、蛋白与核酸相互作用、与蛋白-蛋白相互作用、分子对接,乃至分子相互作用网络等各个层面为科学研究提供助力。为进一步推进相关研究发展,助力广大科研工作者提高蛋白质组学相关数据分析及生物信息学技能,北京市计算中心生物计算事业部推出“蛋白质组学及分子模拟”研习班。欢迎您参加! 


主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司

举办地点:
北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间:
2018.12.10-12 上午:9:30-12:00 下午:13:30–17:00
培训内容:
 

日期

时间

课程名称

课程内容

第一天

09:30-11:00

生物分子互作简介

1. 生物分子互作原理 
  2. 生物分子互作研究方法介绍

11:00-12:00

蛋白质数据库

1. RCSB PDB数据库介绍及使用 
  2. RCSB PDB数据库的使用 
  3. PDB文件格式详解

午餐、午休

13:30-15:00

蛋白结构分析

1. 分子互作可视化软件Pymol、Chimera介绍 
  2. Pymol软件使用 
  3. Chimera软件使用

15:00-17:00

同源建模 
  Homology modeling

1. 同源建模原理介绍 
  2. Swiss-model在线同源建模 
  3. 实例讲解与练习

核酸三维结构获取

1. 核酸结构理化性质概论 
  2. Chimera等软件核酸结构构建

化学小分子结构获取

1. ChemDraw等化学专业构图软件介绍 
  2. ChemDraw实例应用

第二天

09:30-12:00

分子对接 
  Molecular docking

1. 分子对接理论介绍 
  2. 分子对接软件Autodock、Vina等软件介绍 
  2. 分子对接软件(Autodock)的使用 
  3. 实例讲解与练习

午餐、午休

13:30-15:30

蛋白质-蛋白质对接

1. 大分子对接现状分析 
  2. 软件Rosetta软件介绍与使用 
  2. 软件z-dock软件介绍与使用 
  3. 实例讲解与练习

蛋白质-核酸对接

15:30-14:00

虚拟筛选 
  Virtual Screening

1. 计算机辅助虚拟筛选介绍 
  2. ZINC等小分子数据库介绍与应用 
  2. Autodock vina介绍及使用 
  3. 1000体系数据库虚拟筛选实例与练习

第三天

09:30-12:00

药物先导化合物设计与改造

1. 结构上阐述:药物耐药性机理 
  2. 以雌激素受体为例,在生物和化学基础上阐述药物改造机制 
  3. 相关问题答疑;

午餐、午休

13:30-16:00

文章作图 
  实例操作

1. 挑选最新Cell、Nature、Science、PNAS等高端杂志论文,进行生物计算论文思路阐述; 
  2. 挑选Cell、Nature、Science、PNAS等杂志中图形、表格,实例操作

16:00~17:00

听课老师们在做项目探讨解疑


报名费用:

培训费:4000元,(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用); 教材:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社; 附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,食宿自理。

付费方式:

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡 
单位全称:北京市计算中心 
账    号:0200151819100023937 
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行 
(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名+单位”) 


报名优惠活动:

1、11.26日前报名并缴费可优惠200元; 
2、3人以上团体报名每人可减少300元; 
3、4+1团报,可免费赠送一个名额; 
以上优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。 
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排. 

报名表
单位名称:报名课程:开课时间:sxxx
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