实用微生物组学信息分析精品班通知

背      景:

为帮助各领域广大科研人员解决从方案设计、数据解读、图表绘制、数据挖掘和文章设计各环节中遇到的问题。北京市计算中心特聘请XX一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程,为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到70%,整套课程教学目的明确,从微生物组学实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、物种注释到数据分析和结果呈现整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加! 

主办单位:
中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:
北京市计算中心
协办单位:

云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司

举办地点:
北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间:
2018年12.24-27日(报名中)上午:9:30 - 12:00 下午:1:30 – 5:00
培训内容:
 

日期

上课时间

授课题目

授课内容

第一天

9:30-12:00

微生物组学研究概论及进展

1、微生物组研究的发展历史

2、微生物测序分析技术及实验技术原理

3、研究热点分享

13:30-17:00

经典案例分享和方案设计与文章架构设计

1、微生物组学经典文章回顾,未来微生物组学发展方向

2、已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案

3、文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧

第二天

9:30-12:00

Linux基础操作

1、Linux常用命令使用和上机操作

2、Linux环境下软件安装

16s测序分析结果解读

1、OUT分析

2、物种分类与丰度分析

3、Alpha多样性分析

4、Beta多样性分析

5、显著性差异分析

13:30-17:00

16s数据分析

(上机)

1、质控与数据拼接

2、OTU聚类

3、物种注释

4、统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。

第三天

9:30-12:00

宏基因组测序分析结果解读

1、物种注释分析

2、差异物种分析

3、差异基因分析

4、功能注释分析

5、MGS分析

13:30-17:00

宏基因组数据分析(上机)

1、质控

2、拼接组装

3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等

4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等

5、功能注释:RAMMCAP;Blast等

6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)比较分析

第四天

9:30-12:00

R的数据处理功能及统计应用

1、R的安装、运行与使用

2、R语法介绍(R基本符号)

3、R数据处理,对R语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围

13:30-17:00

R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用

1、基础绘图工具(绘图函数、参数、画图面板分割及图形的保存)

2、微生物组学数据结果制作案例实际操作

 


报名费用:

培训费:5200/人(材料费、上机费、午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用) 材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。

附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。


付费方式:

 现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡 
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937  
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行 
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注上单位名称)  

报名优惠活动:

1、11.20前报名成功并缴费每人可优惠300元 
2、3人以上团体报名每人可减少300元; 
3、4+1团报,可免费赠送一个名额;

老学员参加及老学员推荐参加的学员均可额外优惠200元。              
培训座位按收到报名表先后顺序安排。   


报名表
单位名称:报名课程:开课时间:sxxx
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