生命科学的数据可视化与科研作图——使用工具与技巧

内容安排:每天3个主题

授课题目

授课内容

主题1:生命科学SCI作图概述与基础知识

 

1.        生命科学可视化与各类图示例

2.        SCI论文发表图表的基本要求

3.        高清位图(tif等):分辨率PPI/DPI

4.        矢量图(SVG等):放大不失真

5.        抠图、组图

6.        图像色彩转化

7.        数据清洗与预处理

8.        数据缺失与填补

9.        数据格式转化

主题2:通用作图技术与工具

 

10.    基础技术:Excel+PPT

11.    进阶技术1:PhotoShop(PS)

12.    进阶技术2:AdobeIllustrator

13.    进阶技术3:Acrobat   Professional(PDF)

14.    进阶技术4:科研示意图

主题3:常见SCI数据图

 

15.    散点图与曲线(Plot):趋势与回归

16.    条形图(Bar):比较与差异)

17.    直方图(Hist):频率与分布

18.    饼图(Pie):百分比

19.    箱线图(Box-plot):统计描述

20.    韦恩图(Venn diagram):并集与交集

主题4:DNA-基因组遗传与变异

 

21.    BioEdit:DNA测序峰图

22.    GSDS:基因结构图

23.    UCSC:基因组图谱

24.    Blast:序列比对图

25.    IGV:二代测序SNP

26.    Weblogo:序列保守

27.    Circos:基因组比较-圈图

主题5:RNA-基因表达

 

28.    MA plot:差异表达

29.    火山图:

30.    聚类图:

31.    热图(Heatmap):

32.    WEGO:基因本体

33.    PCA图:主成分分析

34.    富集分析

主题6:蛋白-结构与功能

 

35.    蛋白质保守序列

36.    蛋白质二级结构

37.    蛋白质3D结构展示

38.    蛋白质复合体

主题7:分子互作-通路与网络

 

39.    KEGG:代谢通路图

40.    String:分子互作

41.    Cytoscape:网络图

42.    IPA:高级通路分析

主题8:进化树-系统发育与物种分类

 

43.    Mega:系统发育树

44.    iTOL:进化树美化

45.    Evolview:进化树的美化与注释

主题9:人体与疾病:全基因组关联分析

 

46.    曼哈顿图

47.    qqplot

48.    HaploView:单倍型图谱

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

(课程内容以实际授课为准)


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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