日期 | 时间 | 课程名称 | 课程内容 |
第一天 | 09:30-11:00 | 生物分子互作简介 | 1、生物分子互作原理 2、生物分子互作研究方法介绍 |
11:00-12:00 | 蛋白质数据库 | 1、RCSB PDB数据库介绍及使用 2、RCSB PDB数据库的使用 3、PDB文件格式详解 | |
午餐、午休 | |||
13:30-15:00 | 蛋白结构分析 | 1、分子互作可视化软件Pymol、Chimera介绍 2、Pymol软件使用 3、Chimera软件使用 | |
15:00-17:00 | 同源建模 Homology modeling | 1、同源建模原理介绍 2、Swiss-model在线同源建模 3、实例讲解与练习 | |
核酸三维结构获取 | 1、核酸结构理化性质概论 2、Chimera等软件核酸结构构建 | ||
化学小分子结构获取 | 1、ChemDraw等化学专业构图软件介绍 2、ChemDraw实例应用 | ||
第二天 | 09:30-12:00 | 分子对接 Molecular docking | 1、分子对接理论介绍 2、分子对接软件Autodock、Vina等软件介绍 3、分子对接软件(Autodock)的使用 4、实例讲解与练习 |
午餐、午休 | |||
13:30-15:30 | 蛋白质-蛋白质对接 | 1、大分子对接现状分析 2、软件Rosetta软件介绍与使用 3、软件z-dock软件介绍与使用 4、实例讲解与练习 | |
蛋白质-核酸对接 | |||
15:30-14:00 | 虚拟筛选 Virtual Screening | 1、计算机辅助虚拟筛选介绍 2、ZINC等小分子数据库介绍与应用 3、Autodock vina介绍及使用 4、1000体系数据库虚拟筛选实例与练习 | |
第三天 | 09:30-12:00 | 药物先导化合物设计与改造 | 1、结构上阐述：药物耐药性机理 2、以雌激素受体为例，在生物和化学基础上阐述药物改造机制 3、相关问题答疑 |
午餐、午休 | |||
13:30-16:00 | 文章作图 实例操作 | 1、挑选最新Cell、Nature、Science、PNAS等高端杂志论文，进行生物计算论文思路阐述； 2、挑选Cell、Nature、Science、PNAS等杂志中图形、表格，实例操作 | |
16:00-17:00 | 听课老师们在做项目探讨解疑 | ||
