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10X Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班


主 题

简 介

第一天(理论+实操)

10X Genomics单细胞转录组测序技术、单细胞悬浮液或原生质体制备技术

 

n  基因组、生物信息学相关的背景概述

n  10X Genomics单细胞转录组测序技术简介

n  单细胞悬浮液或原生质体制备技术

n  上机操作基础(R语言实操、Linux服务器架构及基本操作


第二天(理论+实操)

单细胞转录组测序技术分析流程(常规分析及高级分析流程介绍及深度解析)

 

n  Cell ranger 质控

n  T-SNE聚类

n  如何确定细胞类群

n  如何寻找bio-marker

n  如何优化分析流程

第三天(理论+实操)

多组学数据深度挖掘、结果展示技巧及高分SCI论文整理思路

 

 

 

n  多组学研究思路

n  多种作图方式结合

(综合利用RPPT等绘图工具拼接完成论文图片)

n  高分辨率SCI论文图片生成

(综合利用AI、pdfviewer生成高质量论文图片)

n  数据重复性评估

(如何在文中体现出不同重复的RNA-SEQ结果、RealtimePCR结果)

n  基因共表达网络构建与Cytoscape展示

n  多组数据表达趋势聚类及深度解析策略