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生命科学的数据可视化与科研作图——使用工具与技巧

随着科研水平的不断提高,期刊论文配图的要求也越来越高。好的文章和图还会被邀请作为期刊杂志封面,科研成果可视化展示高要求的同时,也要求科研人员在成果展示时,提供清晰明了又精美的图片。这也就要求科研人员除了科研能力外还要掌握科研绘图能力。一图胜千言,科研绘图能力已成为科研界传达科研信息不可或缺的有力支撑。

培训目标

从生物医学科研论文配图的图像处理技术和模式图绘制技术入手,旨在提高科研工作者的绘图技能,提升科研成果的信息展示度。使用国际最流行的数据可视化制作软件(Photoshop、Illustrator、Cytoscape)及生物医学领域专业作图工具(R、IGV、WEGO、iTOL、Pymol、Bioedit),配合制作出符合国际规范的、可投稿至世界任何国际期刊的高质量论文配图。让您轻松应对毕业答辩、成果汇报、项目申请书撰写、著作编纂等工作。

主办单位:北京市计算中心

办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

工信部和信息化人才培养工程培训基地

中国生物工程杂志

举办地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

开班时间:2020.4.8-10报名中 上午9:30-12:00,下午13:30-17:00

内容安排:每天3个主题

授课题目

授课内容

教学图示

主题1:生命科学SCI作图概述与基础知识

 

1. 生命科学可视化与各类图示例

2. SCI论文发表图表的基本要求

3. 高清位图(tif等):分辨率PPI/DPI

4. 矢量图(SVG等):放大不失真

5. 抠图、组图

6. 图像色彩转化

7. 数据清洗与预处理

8. 数据缺失与填补

9. 数据格式转化

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主题2:通用作图技术与工具

 

10. 基础技术:Excel+PPT

11. 进阶技术1:PhotoShop(PS)

12. 进阶技术2:Adobe Illustrator

13. 进阶技术3:Acrobat Professional(PDF)

14. 进阶技术4:科研示意图

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主题3:常见SCI数据图

 

15. 散点图与曲线(Plot):趋势与回归

16. 条形图(Bar):比较与差异)

17. 直方图(Hist):频率与分布

18. 饼图(Pie):百分比

19. 箱线图(Box-plot):统计描述

20. 韦恩图(Venn diagram):并集与交集

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主题4:DNA-基因组遗传与变异

 

21. BioEdit:DNA测序峰图

22. GSDS:基因结构图

23. UCSC:基因组图谱

24. Blast:序列比对图

25. IGV:二代测序SNP

26. Weblogo:序列保守

27. Circos:基因组比较-圈图

 

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主题5:RNA-基因表达

 

28. MA plot:差异表达

29. 火山图:

30. 聚类图:

31. 热图(Heatmap):

32. WEGO:基因本体

33. PCA图:主成分分析

34. 富集分析

 

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主题6:蛋白-结构与功能

 

35. 蛋白质保守序列

36. 蛋白质二级结构

37. 蛋白质3D结构展示

38. 蛋白质复合体

 

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主题7:分子互作-通路与网络

 

39. KEGG:代谢通路图

40. String:分子互作

41. Cytoscape:网络图

42. IPA:高级通路分析

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主题8:进化树-系统发育与物种分类

 

43. Mega:系统发育树

44. iTOL:进化树美化

45. Evolview:进化树的美化与注释

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主题9:人体与疾病:全基因组关联分析

 

46. 曼哈顿图

47. qqplot

48. HaploView:单倍型图谱

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(课程内容以实际授课为准)

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

报名费用

注册费:4100元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。培训期间,免费提供工作午餐。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

报名优惠政策

1、2020.3.25之前报名并缴费,可享受减免200元优惠;

2、3人以上团体报名每人可减少300元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额;

4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。


咨询请联系

QQ号:3498448850

张老师:18618295767(微信同号),bcc_peixun@163.com


开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询。