多组学数据分析及挖掘培训班

随着组学技术的快速发展,单一组学的数据难以系统全面地解析疾病发生发展的复杂机制。通过多组学数据来解析科学问题变得尤为重要,SCI论文发表呈现出导向性的多组学整合发展趋势。

那么,

面对眼花缭乱的组学数据该如何分析?

怎样凝练或寻找自己的科学问题?

多组学实验如何设计?

利用组学数据如何发表高分SCI论文?

为了解决研究者的困惑,我们隆重推出《多组学数据分析及挖掘培训班》,邀请具有多年生物信息和数据挖掘的科研项目经验的老师,为您答疑解惑,帮助您少走弯路,快速掌握处理多组学海量数据的基本技能和实用技巧。

主办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

工信部和信息化人才培养工程培训基地

中国生物工程杂志

举办地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程内容:2020415-18 上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00

日期

上课时间

授课题目

授课内容

第一天

9:30-10:30

基因组学及生物信息学概述

1、基因组学与生物信息学背景知识介绍

2、生物信息进展与前沿技术介绍

10:40-12:00

组学技术介绍

基因组学,转录组学,表观组学,蛋白质组学,代谢组学及相关技术介绍

13:30-17:00

基因组学实验设计及数据分析

1、基因组重测序的理论与研究方法及意义

2、全基因组数据分析策略

3、全外显子组、目标区域测序策略与分析

第二天

9:30-12:00

转录组学实验设计及数据分析思路

1、转录组学研究的实验技术和分析基础

2、有reference转录组数据分析思路

3、无reference转录组数据分析思路

4、转录组数据分析上机练习

13:30-17:00

表观组学——DNA甲基化和RNA的联合分析

1、高通量表观遗传组学数据原理

2、DNA甲基化数据分析方法

3、DNA甲基化与转录组联合分析思路

4、零编程复现生物信息文章套路

表观组学——公共数据库及工具介绍

1、 Chip-seq数据分析方法

2、表观组学公共数据库介绍

第三天

9:30-12:00

蛋白质组学实验设计及数据分析

1、蛋白质组数据的鉴定和质量控制方法

2、蛋白质组定量方法

3、蛋白质组数据分析:GO富集分析,Pathway分析等

4、蛋白质基因组学介绍

13:30-17:00

蛋白组在分子机制解析及标志物发掘中的应用(理论+上机操作)

1、蛋白质组鉴定及定量软件上机练习

2、多层组学整合思路探讨及临床蛋白质组学研究案例讲解

3、蛋白质标志物挖掘方法简介

第四天

9:30-12:00

多组学数据整合分析思路介绍

1、基因组和转录组数据整合分析思路介绍:

 1)基因组和转录组数据整合分析

 2)RNA-RNA联合分析

 3)组学数据与临床数据关联分析

 4)基于多组学数据的分子分型

 5)基于多组学数据的biomarker发现

2、基因组和转录组数据整合分析案例介绍

13:30-17:00

多组学数据分析实例演练

1、 甲基化与表达谱关联分析

2、 miRNA的mRNA靶基因分析

3、 miRNA的lncRNA靶基因分析

4、 ceRNA网络构建

5、 多组学与临床数据整合分析

6、 多组学整合分析在线数据库

注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。

(课程内容以实际授课为准)

讲师介绍

讲师团队具有丰富实践经验,由一线分析人员亲自授课。

裴老师,博士,北京市科学技术研究院副研究员,中国科学院北京市基因组所,博士后,北京市计算中心生物计算事业部生物信息工程师。从事基因组与生物信息学研究多年,具有良好的遗传学及生物信息学研究背景与技术,具有大模型数据分析能力,从事关于遗传学、基因组学与生物信息学工作多年,具有大数据分析与机器学习技术工作经验。熟悉各种生物学与统计学专业软件与分析方法。具有较丰富的生物信息学数据分析、处理与高性能计算机的运用、程序开发及数据库平台构建工作经验。

刘老师,博士,助理研究员,博士毕业于中国科学院北京市基因组所,北京市计算中心生物计算事业部生物信息工程师。具有丰富的外显子组、转录组等测序数据分析,疾病基因组数据解读,公共数据库数据挖掘与二次开发经验。具有丰富的生物信息学技术培训授课经验。

闻老师,北京市计算中心生物信息工程师。毕业于军事科学院,研究方向为神经退行性疾病的蛋白质组学研究和电生理学数据挖掘,曾参与国自然、973计划等重大项目,在国际期刊参与表发学术论文4篇。擅长大数据统计学分析和数据挖掘,具有丰富的遗传流行病学、单细胞基因组学、三维基因组学、蛋白质组学的课题设计和数据分析及生物信息学技术培训经验。

袁老师,北京市计算中心生物计算事业部生物信息工程师。本科就读于山东大学生命科学专业,硕士就读于军事科学院生物信息专业。精通R、Python、Shell Script等编程语言,在Linux服务器运维、集群搭建、docker容器技术、数据库与网站搭建及临床相关的组学生物信息分析方面有着丰富经验。

报名费用

注册费:5200元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。培训期间,免费提供工作午餐。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

报名优惠政策

1、2020.4.1之前报名并缴费,可享受减免200元优惠;

2、3人以上团体报名每人可减少300元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额;

4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。


咨询请联系

QQ号:3498448850

张老师:18618295767(微信同号),bcc_peixun@163.com

开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询。

附:部分案例展示图

 转录组与蛋白组差异表达分析.jpg

转录组与蛋白组差异表达分析

 

DNA甲基化与基因表达分析.jpg 

DNA甲基化与基因表达分析

 

LnRNA表达与网络.jpg 

LnRNA表达与网络

 

 circRNA-miRNA-mRNA 之间 ceRNA网络调控网络图.jpg

circRNA-miRNA-mRNA之间ceRNA网络调控网络图


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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