【直播|现场】微生物组学数据分析与挖掘专题培训班

微生物组学数据分析与挖掘实操班

微生物存在于世界的各个角落,在医疗健康、环境治理、农业种植、工业生产等诸多领域发挥着举足轻重的作用。近年来,随着测序技术的发展,对于微生物组学的研究持续火热,微生物存在于世界的各个角落,在医疗健康、环境治理、农业种植、工业生产等诸多领域发挥着举足轻重的作用。成为了科研工作者必不可少的研究技术。然而,对技能的要求也是越来越高,尤其在数据库建立、编程语言开发、绘图工具使用技巧及算法模型选择成为广大科研工作者面临的具体问题。

本次生信培训班分为四个阶段

1、掌握必备的基础知识

如微生物组研究现状与应用、分析流程、方案设计以及Linux的常用操作和软件安装等。

2、掌握16S以及宏基因组数据分析结果及应用

深度剖析16S与宏基因组建库测序原理及分析结果解读,深度诠释各个分析结果。

3、手把手带你进行微生物组学数据的分析

包括微生物多样性测序数据处理和宏基因组数据分析,如原始数据的质控和拼接、OTU聚类、物种注释、宏基因组数据的组装、基因预测以及基于物种丰度、功能丰度表进行的有效信息的统计分析。

4、深度体验微生物组大数据挖掘的奥秘

基于丰富的项目分析经验,针对不同研究目的,提供专业性分析方案及数据深度挖掘思路,并通过不同软件进行结果可视化。

主办单位:北京市计算中心

协办单位:北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地

北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地

听课方式:线上直播、现场听课,按需选择。

课程安排:2020.8.12-14  上午9:30-11:30   下午13:30-17:00

日期

主题

内容

备注

第一天

微生物组学研究现状及应用

1、微生物组学研究现状及应用

2、微生物组数据分析流程设计

3、常用数据库介绍

4、方案设计与案例分享

理论+

上机操作

微生物组学数据分析上机基础

1、Linux常用命令使用和上机操作

2、Linux环境下软件安装

微生物多样性数据分析

1、质控流程:双端序列合并、提取barcode、质控、样品拆分、切除引物

2、生成OTU:序列格式转换、去冗余、聚类生成OTU

3、OTU筛选:嵌合体生成原理及去除方法、筛选细菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表

4、物种注释及进化树构建

5、常用Alpha多样性指数计算

6、常用Beta多样性距离矩阵计算

7、统计分析

7.1、箱线图展示Alpha多样性及组间比较统计

7.2、散点图展示样品及组间主坐轴分析(PCA/PCoA/NMDS)

7.3、样品与组间相关分析,并用热图可视化结果

演示+

上机操作

第二天

宏基因组数据分析与结果解读

1、宏基因组分析基本策略

2、数据质量评估

3、数据质量过滤

4、宿主污染过滤

5、数据组装

6、基因预测

7、物种注释(MEGAN、Krona)

8、功能注释(KEGG、eggNOG)

9、统计分析

9.1、样本聚类分析(物种、功能、基因)

9.2、差异分析(物种、功能、基因)

演示+

上机操作

第三天

数据挖掘与可视化实现

1、R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用

韦恩图、花瓣图、散点图、热图、盒形图(箱线图)等

2、网络分析MENAIgraphCytoscape

3、物种与样本关系Circos分析

4、差异物种分析LEfSe分析

5、KEGG和COG预测分析

PIRUSt预测及STAMP 

6、进化分析ITOL

演示+

上机操作

注:课程以实际发生为准若调,会提前通知。

报名费用

听课方式

注册费

备注

线上直播

4200元/人

本次听课费、上机账号1个资料费、证书费、考试费(如有)

赠送一年内同等金额同课程体系线下班一个和线下7折班一个备注:若您不方便参加线下班可将赠送的线下班换成2个线上班。)

现场听课

3600元/人

本次听课费、上机账号1个资料费、证书费、考试费(如有)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

课程结束后,可将上课期间用到的数据、PPT资料、脚本、视频等相关文档,通过移动硬盘邮寄的方式快递到您手上,便于您后续继续学习使用。

报名优惠政策

13人以上团体报名每人可减少300元;

24+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

包年优惠价

按年付费,45000元/人。包括报名后1年以内所有线上课程;高性能计算资源基础账号1个,使用期限1年;线下培训名额2个。

付费方式

银行账号信息:

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

咨询请联系

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881

开课前三天会发送邮件通知确认开课后,开课前一天会将直播链接及上机账号发至您邮箱或微信。如未收到,请及时电话咨询。

附:课程部分示例图片

1R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用

韦恩图、花瓣图、散点图、热图、盒形图(箱线图)等

 图2.jpg

 图1.jpg

 图4.jpg

 图5.jpg

 图3.jpg

2、网络分析

MENA Igraph Cytoscape

图6.jpg 

3、物种与样本关系

Circos分析

 图7.jpg

4、差异物种分析

LEfSe分析

图8.jpg

图9.jpg

5KEGGCOG预测分析 

PIRUStSTAMP

 图10.jpg

6、进化分析

ITOL

图11.jpg


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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