生物信息学Python语言实战班


 

Python是一种简单易学,功能强大的编程语言。它有高效率的高层数据结构,能够简单、有效地实现面向对象编程。Python语法简洁,支持动态输入,是解释性语言。在大多数平台上,对于众多领域,Python都是一个理想的开发语言,特别适合于应用程序的快速开发。Python在生物信息领域更是有着广泛的用途,几乎是入门生物信息学的首选编程语言。

课上针对目前实用的众多python扩展包,例如科学计算、网络爬虫等都会有所涉及。

培训特色:

1、全面的课程--技术应用、原理流程、实例联系全贯穿

2、理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会

3、增值服务,课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答

培训目标:

掌握生物信息学与Python的基础知识,学会Python执行最常见的编程,了解BioPython的基本应用,通过生物信息学Python程序实例与应用,深刻理解并掌握生物信息学Python语言使用的要点。

主办单位:北京市计算中心

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地

北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地

 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:2020年11月24-27日 上午9:30-11:30   下午13:30-17:00

日期

授课题目

授课内容

备注

第一天

Python概述及其在生物信息领域的应用

概括介绍Python语言的概念及特点,及其在生物信息领域的应用

操作

Python软件安装、运行与基本操作

Python及iPython的安装及使用,Python程序的运行;DOS、Unix命令行操作基本命令;Python变量定义、数字及基本运算

核心数据类型(1)

列表、元组

操作

基本语法结构

判断结构、循环结构、异常处理

实例练习

使用python编程,生成斐波那契数字序列

第二天

核心数据类型(2)

字符串、字典

操作

文件与文件夹操作

文件的读入与写入、文件夹操作

实例练习

FASTA文件的处理:

1、序列基本信息的统计(序列数、碱基数、及平均长度)

2、fasta序列反向互补转换和切割

第三天

函数和模块

系统库函数、第三方函数、自定义函数;模块定义、导入、使用

操作

正则表达式

Python特色功能正则表达式学习与应用

实例练习

系统命令在python中的调用

实例练习

大数据文件的分割及合并

第四天

BioPython简介及应用实例

BioPython安装及学习,生物信息学中的实际应用

操作

BioPython快速应用

使用BioPython处理传统的生物信息数据

实例练习

应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。

应用biopython在blast xml结果文件中提取目的信息。

注:课程以实际发生为准;若调,会提前通知。

报名费用

注册费:4200元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。培训期间,免费提供工作午餐。

提供当期直播回放(北京市计算中心羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

注:凡9月开学季报名缴费者有机会获赠价值186元《高通量测序与高性能计算理论和实践》书籍一本。限量50本,先到先得。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

咨询请联系

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881

开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。

 


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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