10X Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班


细胞图谱构建、细胞亚群分析、稀有细胞类型鉴定、肿瘤微环境、肿瘤耐药性…,单细胞转录组测序技术已成为近几年非常热门的话题之一。同时,转录组学数据泛滥的时代,如何才能找到数据中的亮点?如何深度挖掘数据中隐藏的创新点,让科研工作者掌握几种深度解析组学数据的方法?本课程一共3天,理论与实战相结合。培训内容包括单细胞制备技术、单细胞转录组分析标准流程、差异基因分析、功能富集分析、流程优化、常规转录组测序数据分析、多组学数据整合挖掘分析、SCI论文图表整理。

 

主办单位:北京市计算中心

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地

北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地

 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:2020年11月25-27日   上午9:30-11:30   下午13:30-17:00

日期

主题

内容

备注

第一天

10X Genomics单细胞转录组测序技术

10X Genomics单细胞转录组测序技术简介

10X Genomics空间转录组测序技术简介

理论+

上机操作

上机操作基础

1. R语言实操

2. Linux服务器架构及基本操作

第二天

单细胞转录组测序技术分析流程

(常规分析及高级分析流程介绍及深度解析)

1. Cell ranger 质控

2. T-SNE聚类

3. 如何确定细胞类群

4. 如何寻找bio-marker

5. 如何优化分析流程

理论+

上机操作

第三天

多组学数据深度挖掘、结果展示技巧及高分SCI论文整理思路

1. 多组学研究思路

2. 基因共表达网络构建与Cytoscape展示

3. 多组数据表达趋势聚类及深度解析策略

4. 多种作图方式结合

(综合利用R、PPT等绘图工具拼接完成论文图片)

5. 高分辨率SCI论文图片生成

6. 综合利用AI、pdfviewer生成高质量论文图片)

7. 数据重复性评估

(如何在文中体现出不同重复的RNA-SEQ结果、Realtime PCR结果)

上机操作

注:课程以实际发生为准;若调,会提前通知。

报名费用

注册费:4200元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。培训期间,免费提供工作午餐。

提供当期直播回放(北京市计算中心羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

注:凡9月开学季报名缴费者有机会获赠价值186元《高通量测序与高性能计算理论和实践》书籍一本。限量50本,先到先得。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

咨询请联系

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881

开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。

 


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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