遗传流行病学的分析方法主要有家系调查和系谱分析、双胞胎分析、病例对照研究、家系调查与群体调查相结合、半同胞与养子分析、患病率与死亡率分析、通径分析、分离分析、连锁分析和相关分析等。
实际上,近年来遗传流行病学已经分为两个分支:一个是宏观遗传流行病学,主要研究人群和家系的资料,首先探明疾病有无家庭聚集性,主要是垂直的,即代与代之间的;其次是水平的,即同胞之间的。另一个分支是微观遗传流行病学,即细胞及分子水平的遗传流行病学,主要应用分子遗传学的方法,为从人群或家系资料得到的结果提供进一步的证据。完整的遗传流行病学研究应当既要有亲代与子代传递的实验室证据,还要有人群和家系的资料,从而揭示遗传因素、环境因素以及二者的交互影响在疾病形成中定性和定量的作用。
通过本课程学习,使学习者了解遗传流行病学在生命科学研究领域中的重要作用,熟悉遗传流行病学知识体系的整体框架,系统掌握基本原理和方法;树立他们的遗传流行病学的思维能力,增强运用群体研究的方法处理和分析临床数据能力。遗传流行病学(核心篇)的特点是以关联分析为侧重点讲解,带你深入理解群体分析思路,精讲各个模型。
主办单位:北京市计算中心
协办单位:
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地
北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地
举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
日程安排:2021年9月13-17日 上午9:30-11:30,下午13:30-17:00
时间 | 主题 | 内容 | ||
第一天 | 遗传度分析 | 遗传度的概念 1. 定义 2. 用简单线性模型估计遗传度 | ||
方差组分模型 1. 遗传方差组分 2. 环境方差组分 3. 根据亲属资料估计方差组分 4. 方差组分估计得一般性方法 5. 方差组分模型的诠释 | ||||
通径分析 1. 通径模型的构建 2. 通径系数的估计 3. 通径模型的诠释 | ||||
质量性状遗传度的估计 1. 风险函数的含义 2. 与方差组分模型的比较 3. 与通径模型的比较 4. 多因素模型对再发风险的估计 | ||||
第二天 | 分离分析 | 分离分析的基本概念 | ||
分离分析中家系的确证和收集 1. 家系的确证 2. 序贯抽样 | ||||
经典分离分析法 1. 基本原理 2. 确证校正和估计分离比 3. 样本含量 4. 关于确证校正的其他问题 | ||||
综合分离分析 1. 定义基本参数 2. 计算似然函数 3. 确证校正 4. Class D 回归模型 5. 最优选择模型 | ||||
分离分析局限性 | ||||
第三天 | 连锁分析 | 概述 2.连锁分析的过程 3. 连锁分析的分类 | ||
连锁分析的遗传学基础 1. 减数分裂 2. 重组和作图函数 3. 血缘一致性的状态一致性 | ||||
连锁分析的方法 1. 直接计数法 2. LOD值法 3. 亲属对方法 4. 连锁分析方法的选择 5. 连锁分析研究设计相关的问题 | ||||
第四天 | 连锁不平衡定位 | 连锁不平衡 1. 连锁不平衡的定义 2. 导致遗传标记物与致病基因间连锁不平衡的机制 3. 连锁不平衡的的度量 | ||
连锁不平衡的定位机制 1. 连锁不平衡定位的基本思想 2. 对连锁不平衡定位具有重要意义的两种机制 | ||||
连锁不平衡定位参数模型 1. 评估致病基因的经验方法 2. 单体型共享方法 3. 基于合并的参数方法 4. 人类基因组中的连锁不平衡简述 | ||||
单体型区块与连锁不平衡 1. 单体型 2. 单体型区块 3. 单体型区块与连锁不平衡 | ||||
第五天 | 全基因组关联分析 | GWAS的生物学框架和数学框架 1. 全基因组关联分析理论基础 2. 环境因素影响下的微效多基因模型框架 3. 单点扫描模型 | ||
GWAS的混杂因素 1. 混杂因素在GWAS研究中的影响与控制策略 2. 表型组来源的混杂因素 3. 基因组来源的混杂因素 |
注:课程为理论课,内容会根据每期报名学员的整体情况对内容讲解侧重点进行调整。
【报名费用】
线上直播:遗传流行病学基础知识900元,遗传流行病学(核心篇)6000元,遗传流行病学(提高篇)5500元。同时参加2个班享受9折;参加3个班享受8.5折。线上直播可回放。
现场听课:遗传流行病学基础知识900元,遗传流行病学(核心篇)6000元,遗传流行病学(提高篇)5500元。同时参加2个班享受9折;参加3个班享受8.5折。
注册费含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有)。培训期间,免费提供工作午餐。
提供当期视频回放(北京市计算中心羽林学院平台)。
开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
【注】
开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。
课程将按照收到报名表时间顺序排座位,参会名额25个,报满为止