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生物大数据时代的网络药理学研究模式学习班

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人工智能以及云计算技术的快速发展,精准医学与医学大数据在生命科学领域的作用越来越明显。在人工智能的潮流中,中医药也迎来了新的发展契机。网络药理学是人工智能和大数据时代药物系统性研究的新兴、交叉、前沿学科,强调从系统层次和生物网络的整体角度出发,解析药物及治疗对象之间的分子关联规律,被广泛应用于药物和中药活性化合物发现、整体作用机制阐释、药物组合和方剂配伍规律解析等方面,为中药复杂体系研究提供了新思路,为临床合理用药、新药研发等提供了新的科技支撑。

在大数据背景下,随着网络药理学的影响力和应用日益广泛,网络药理学在理论分析、算法发展和实际应用等方面,面临着重要的发展机遇和挑战。整合临床、实验的海量数据,结合科学验证,揭示药物对疾病的调控机制,是网络药理学研究的主要任务。


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中医药是中华民族的宝贵财富,在疾病防治方面具有独特的优势。中医整体观与以网络和系统为特征的新一代医学研究范式相吻合。中医提出了一种全新的“网络靶标”方法,即网络药理学的核心理论和方法。中医也是网络药理学的一个重要研究对象。中医网络药理学,旨在了解复杂疾病、中医证候和中药治疗的网络生物学基础,在网络药理学的起源和发展过程中起着至关重要的作用。



   

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为更好地了解网络药理学的新进展,包括预测中药靶标,了解疾病和证候的生物学基础,中药方剂的网络调控机制,以及基于生物网络的疾病和证候标志物的识别。这些研究呈现出计算、实验和临床相结合的趋势,是未来中药网络药理学研究的一个很有前途的方向。北京市计算中心生物计算事业部特举办“生物大数据时代的网络药理学研究模式研讨班”。培训班由北京市计算中心的一线分析工程师授课,通过技术讲座结合实验操作,展示应用实例,现场解答技术疑问,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平和竞争力。

授课对象:生物信息学学员,高校生物、药学相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员

电脑要求:

电脑要求:64位windows10操作系统,运行日常程序流畅。

主办单位:北京市计算中心有限公司

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

工业和信息化人才培养工程培训基地

北京市大数据教学实践基地

举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:2021.11.3-5(周三--周五)上午9:30-11:30   下午13:30-17:00


日期

主题

内容

备注

第一天

主题1:网络药理学研究思路

1、网络药理学的发展历程和研究现状简介

2、网络药理学SCI论文研读分析

3、网络药理学的研究思路及技术路线

理论

主题2:网络药理学的数据来源

4、中药有效成分查找和获取

(1)常用中药数据及使用:TCMID、YaTCM、TCMSP

(2)小分子化合物结构信息查询:Pubchem、Drugbank

5、中药所治疗疾病的相关基因查找和获取

(1)人类疾病与基因遗传变异数据库:OMIM

(2)疾病相关的基因与突变位点数据库DisGeNet

(3)人类基因数据库:Genecards

(4)治疗靶标数据库:TTD

6、中药有效成分靶点的查询及获取

(1)中药有效成分靶点的预测:SwissTargetPrediction

(2)基于有效成分结构特征靶点预测:PharmMapper

(3)蛋白结构数据库及结构数据的筛选和获取:PDB

(4)中药有效成分靶点的获取:反向虚拟筛选方法

理论+

实战

第二天

主题3:网络药理学数据整理及分析

7、中药分子机制研究的在线生物信息学分析工具: BATMAN-TCM

8、中药高通量实验和参考数据库:Herb

9、中医药证候关联数据库:SymMap

10、细胞代谢及信号传导通路数据库:KEGG

11、蛋白质互作网络查询和可视化分析:STRING

12、化合物与蛋白质互作:STITCH

13、富集分析数据库:DAVID

14、基因/蛋白质功能注释和功能集富集分析: Kobas数据库

理论+

实战

第三天

主题4.网络药理学数据可视化

15、网络分析软件:Cytoscape

(1)分析数据导入与导出

(2)基本拓扑特征计算

(3)重要节点识别

(4)网络拓扑指标含义

(5)子网络提取

(6)网络可视化

(7)图形导出

(8)Cytoscape插件的安装和使用

16、综合性分析软件:IPA

(1)基于IPA经典通路分析

(2)基于IPA疾病与功能分析

(3)基于IPA生物分子网络构建

(4)基于IPA的因果网络分析

17、分子对接及相互作用分析

(1)对接软件的介绍及安装

(2)小分子和蛋白结构文件的预处理

(3)蛋白活性位点的确定

(4)分子对接流程的介绍及实操

(6)分子对接结果相互作用分析及可视化

理论+

实战




报名费用

注册费:4200元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。培训期间,食宿自理。

提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称:北京市计算中心有限公司

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。


咨询请联系

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881

开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。