计算生物学是一门典型的交叉学科，涉及的学科包括数学、统计学、化学、物理学、生物学和计算机科学等。就整个学科的内容而论，计算生物学最终是以生命科学中的现象和规律作为研究对象，以解决生物学问题为最终目标，数学和计算机仅仅是解决问题的工具和手段。
计算生物学领域的研究进展极大地加深了我们对和疾病密切相关的分子靶标的认识。所有生命过程的实现都是相应蛋白质发挥相应功能实现的，然而，如何有效地利用基本生物学信息，还需要我们从分子甚至原子水平上来掌握生物大分子的三维结构和相关分子之间（蛋白质、核酸、小分子）的相互作用，进而针对疾病靶标来设计治疗性药物。
本研讨班旨在具体蛋白质与相关分子（蛋白质、核酸、小分子）的结构预测，并进一步进行分子动力学模拟预测结构在实际反应体系下的结构特点，进而为生命现象的解释及疾病靶标的改造提供支撑。
本次研讨班分为四个阶段
1、掌握必备的基础知识
深刻解读蛋白质结构文件、蛋白质三维结构获取，蛋白质三维结构展示，相关软件安装和操作等。
2、掌握相关分子结构预测流程
以实际操作为例，形象展示蛋白质、核酸、小分子结构的预测流程及三维结构查看，为后续分子动力学模拟奠定基础。
3、掌握分子动力学模拟流程
以实际结构为例，详细介绍分子动力学的原理、软件过程及后续结果分析。
4、基于分子结构预测和分子动力学模拟的研究思路
以实际案例和高分论文为例，讲解计算生物学研究思路
授课对象：有计算生物学分析需求的或者希望深入了解并掌握分子结构数据库及分析工具的研究生、科研工作者。
学员基础：由于培训具备一定的深度和广度，我们希望学员应具有学习计算生物学软件的兴趣、基本的生物、化学概念和相关基础知识。
电脑要求：64位windows10操作系统，运行日常程序流畅。
主办单位：北京市计算中心有限公司
协办单位：
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
工业和信息化人才培养工程培训基地
北京市大数据教学实践基地
举 办 地：北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程安排：2022年5月25日-27日（周三--周五） 上午9:30-11:30 下午13:30-17:00
时间 | 主题 | 授课内容 | 备注 |
第一天 | 计算生物学研究方法及蛋白质数据库使用 | 1、计算生物学概述 | 理论+实操 |
计算生物学研究方法及蛋白质数据库使用 | 4、PDB文件: 蛋白质结构文件详解 | 理论+实操 | |
生物分子结构可视化软件介绍与使用 | 6、VMD：结构可视化软件操作演练 | 理论+实操 | |
分子动力学模拟原理及软件实操 | 10、NAMD：分子动力学模拟软件操作演练； | 理论+实操 | |
第二天 | 蛋白质结构预测原理及软件实操 | 11、同源建模原理介绍 | 理论+实操 |
其它生物分子结构预测原理及软件实操 | 17、NDB：核酸结构数据库及核酸结构预测 | 理论+实操 | |
第三天 | 分子动力学模拟原理及软件实操 | 19、Linux常用命令使用和上机操作 | 理论+实操 |
分子动力学模拟原理及软件实操 | 21、分子动力学简介；21、Gromacs：分子动力学模拟软件操作演练（Linux操作系统下） | 理论+实操 |
注：课程以实际发生为准；若调，会提前通知。
【报名费用】
注册费：4200元/人（含当期听课费、资料费、证书费、考试费（如有））。培训期间，食宿自理。
提供当期视频回放以供复习使用（羽林学院平台）。
开具增值税发票，提供盖章通知、结业证书等相关材料。
本期班享受“报赠”特惠活动，即：注册费≥4000元的，即可获赠羽林学院视频课2个/人，＜4000元者，可获赠羽林学院视频课1个/人（具体赠送课程请加下方老师微信详询）。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元；
2、4+1团报，可免费赠送一个名额；
3、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种；
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
【付费方式】
现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡
单位全称：北京市计算中心有限公司
账号：0200151819100023937
开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
（汇款信息备注：“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称）
注：款项支出后，请提供付款回执给工作人员，方便核实到账、开具发票。
【咨询请联系】
QQ号：3498448850
邮箱：bcc_peixun@163.com
张老师 18618295767（微信同号）
于老师 15621925881
【注】开课前一周会发送邮件通知；若未接到邮件通知，请电话咨询。
