基因组关联分析技术应用培训班

日期

授课题目

授课内容

第一天

基因组关联分析理论基础

1 基因组学与生物信息学概述;

2 基于群体遗传的数据获取;

3 基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍;

4 常用GWAS数据库介绍;

Plink软件基础应用

5 Plink软件应用;

6 Plink文件格式生成与解析;

7 等位基因频率计算;

8 哈-温平衡计算;

9 目标区域数据提取;

10 基因组关联分析流程;

11     关联分析结果分析与p校正;

第二天

基因型填充Imputation

12 基因型填充Imputation的原理及应用;

13 Beagle软件介绍与应用;

14 基因组填充的方法与分析流程;

15 1000G数据应用

Plink软件进阶应用

16 基于家系的关联分析;

17 曼哈顿图的绘制与结果展示;

18 SNP位点的condition分析;

19     Meta gwas数据分析;

第三天

Haploview软件

20 Haploview软件应用;

21 Haplotype单倍型分析;

22 LD连锁不平衡指数计算;

23 SNP marker之间的r2、D值等计算;

Tassel软件

24 Tassel软件应用;

25 Tassel基于命令行的批量数据分析;

26 生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等;


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

主页链接

js