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计算机辅助设计工程师培训 --B.生物大数据时代的网络药理学研究模式学习班

北京市计算中心有限公司作为工业和信息化部教育与考试中心认定的工业和信息化人才培养工程培训基地,该培训结束后通过统一考试的学员,可获得“工业和信息化部教育与考试中心”授予的职业技术证书。该证书可作为专业技术人员职业能力考核的证明,以及专业技术人员岗位聘用、任职、定级和晋升职务的重要依据。

证书等级:高级

预习部分:【免费赠送|视频课程】生物分子互作软件使用(12章33节)

集中学习:三天线上直播,2022.7.27-29

本期主题课程相关信息如下:

 

人工智能以及云计算技术的快速发展,精准医学与医学大数据在生命科学领域的作用越来越明显。在人工智能的潮流中,中医药也迎来了新的发展契机。网络药理学是人工智能和大数据时代药物系统性研究的新兴、交叉、前沿学科,强调从系统层次和生物网络的整体角度出发,解析药物及治疗对象之间的分子关联规律,被广泛应用于药物和中药活性化合物发现、整体作用机制阐释、药物组合和方剂配伍规律解析等方面,为中药复杂体系研究提供了新思路,为临床合理用药、新药研发等提供了新的科技支撑。

在大数据背景下,随着网络药理学的影响力和应用日益广泛,网络药理学在理论分析、算法发展和实际应用等方面,面临着重要的发展机遇和挑战。整合临床、实验的海量数据,结合科学验证,揭示药物对疾病的调控机制,是网络药理学研究的主要任务。

 

中医药是中华民族的宝贵财富,在疾病防治方面具有独特的优势。中医整体观与以网络和系统为特征的新一代医学研究范式相吻合。中医提出了一种全新的“网络靶标”方法,即网络药理学的核心理论和方法。中医也是网络药理学的一个重要研究对象。中医网络药理学,旨在了解复杂疾病、中医证候和中药治疗的网络生物学基础,在网络药理学的起源和发展过程中起着至关重要的作用。

 

为更好地了解网络药理学的新进展,包括预测中药靶标,了解疾病和证候的生物学基础,中药方剂的网络调控机制,以及基于生物网络的疾病和证候标志物的识别。这些研究呈现出计算、实验和临床相结合的趋势,是未来中药网络药理学研究的一个很有前途的方向。我中心生物计算事业部特举办“生物大数据时代的网络药理学研究模式研讨班”。培训班由我中心的一线分析工程师授课,通过技术讲座结合实验操作,展示应用实例,现场解答技术疑问,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平和竞争力。

授课对象:生物信息学学员,高校生物、药学相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员

电脑要求:64位windows10操作系统,运行日常程序流畅。

参与方式:线上直播

集中学习:2022.7.27-29(周三--周五)上午9:30-11:30   下午13:30-17:00

日期

主题

内容

备注

第一天

主题1:网络药理学研究思路

1、网络药理学的发展历程和研究现状简介

2、网络药理学SCI论文研读分析

3、网络药理学的研究思路及技术路线

理论

主题2:网络药理学的数据来源

4、中药有效成分查找和获取

1)常用中药数据及使用:TCMID、YaTCM、TCMSP

2)小分子化合物结构信息查询:Pubchem、Drugbank

5、中药所治疗疾病的相关基因查找和获取

1)人类疾病与基因遗传变异数据库:OMIM

2)疾病相关的基因与突变位点数据库DisGeNet

3)人类基因数据库:Genecards

4)治疗靶标数据库:TTD

6、中药有效成分靶点的查询及获取

1)中药有效成分靶点的预测:SwissTargetPrediction

2)基于有效成分结构特征靶点预测:PharmMapper

3)蛋白结构数据库及结构数据的筛选和获取:PDB

4)中药有效成分靶点的获取:反向虚拟筛选方法

理论+

实战

第二天

主题3:网络药理学数据整理及分析

7、中药分子机制研究的在线生物信息学分析工具: BATMAN-TCM

8、中药高通量实验和参考数据库:Herb

9、中医药证候关联数据库:SymMap

10、细胞代谢及信号传导通路数据库:KEGG

11、蛋白质互作网络查询和可视化分析:STRING

12、化合物与蛋白质互作:STITCH

13、富集分析数据库:DAVID

14、基因/蛋白质功能注释和功能集富集分析: Kobas数据库

理论+

实战

第三天

主题4.网络药理学数据可视化

15、网络分析软件:Cytoscape

1)分析数据导入与导出

2)基本拓扑特征计算

3)重要节点识别

4)网络拓扑指标含义

5)子网络提取

6)网络可视化

7)图形导出

8)Cytoscape插件的安装和使用

16、综合性分析软件:IPA

1)基于IPA经典通路分析

2)基于IPA疾病与功能分析

3)基于IPA生物分子网络构建

4)基于IPA的因果网络分析

17、分子对接及相互作用分析

1)对接软件的介绍及安装

2)小分子和蛋白结构文件的预处理

3)蛋白活性位点的确定

4)分子对接流程的介绍及实战

5)分子对接结果相互作用分析及可视化

理论+

实战

注:内容以实际发生为准;若调,会提前通知。

报名费用

注册费:4200元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费)。

提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

优惠活动

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

付费方式

手机银行或电子银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心有限公司

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京自贸试验区永丰基地支行

(汇款信息备注:“智能计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

咨询请联系

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881


开始前三天会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。