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实用生物信息学研讨班


如您所知,近年来,以基因组科学为代表的研究工作和技术平台先后获得各项资助,如国家863计划、973计划、中国科学院知识创新工程、国家重大攻关项目、自然科学基金等。为了辅助广大科研工作者掌握高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能,我中心特举办此“实用生物信息学研讨班”。

主办单位:北京市计算中心有限公司

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

工业和信息化人才培养工程培训基地

北京市大数据教学实践基地

举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:2022年11月7-11日(周一—周五)  上午9:30-12:00  下午13:30-17:00

日期

主题

内容

备注

第一天

组学及生物信息学概述

1、组学研究概述(基因组学、转录组学、表观组学、蛋白质组学、代谢组学及相关技术介绍)

2、实验设计及测序原理

3、生物信息学背景知识介绍

理论

Linux服务器使用入门

1、掌握Linux系统下的常用命令(重点讲解)

2、掌握Linux环境下软件的安装使用

3、了解Shell脚本的编写

实战

R语言入门

1、R语言简介

2、R语言安装及配置

3、R语言数据结构

4、R语言数据处理

5、R语言绘图

理论+

实战

第二天

转录组数据分析

1、转录组技术发展前沿动态

2、转录组应用案例及应用热点

3、常用的转录组实验设计及测序建库技术

4、转录组分析方法介绍

理论

转录组数据分析实例(上机操作)

1、转录组数据准备和软件介绍及安装

2、转录组数据的比对(重点讲解)

3、表达量估计和分析(重点讲解)

理论+

实战

第三天

基因组重测序与数据分析

1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用

2、结合实例讲解其原理、数据类型与格式、操作流程、软件等相关知识

理论

基因组重测序数据分析实例(上机操作)

1、对二代测序数据的解读

2、数据质量控制及数据过滤

3、使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化(重点讲解)

4、寻找SNP和Indel并进行注释(重点讲解)

5、寻找结构变异并对变异进行注释(重点讲解)

理论+

实战

第四天

microRNA测序与数据分析

1、microRNA的定义、应用和发展

2、microRNA的生物学过程

3、microRNA研究的实验设计及测序原理

4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解)

5、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景

6、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)

7、近期文献

理论

microRNA数据分析实例(上机操作)

1、microRNA测序数据预处理(重点讲解)

2、测序数据长度分布计算

3、microRNA的预测(重点讲解)

4、microRNA碱基偏好性计算

5、microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)

理论+

实战

第五天

10×单细胞转录组测序数据分析原理

1、单细胞测序技术研究现状及应用

2、单细胞转录组实验设计及建库测序原理(重点介绍10× Genomics)

3、空间转录组实验设计及建库测序原理

理论

10×单细胞转录组测序数据分析流程上机操作

1、10×单细胞软件Cellranger处理测序原始数据实战

2、R包Seurat细胞分群、umap、t-sne、marker基因筛选实战

实战

蛋白结构与互作分析

1、PyMol

2、Cytoscape

实战

注:内容以实际发生为准;若调,会提前通知。

【报名费用】

注册费:5400元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。

提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

【报名优惠政策】

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

【付费方式】

手机银行或电子银行转账、银行汇款等

单位全称:北京市计算中心有限公司

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京自贸试验区永丰基地支行

(汇款信息备注:“智能计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

咨询请联系】

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881

【注】开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。




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