第三代测序技术及信息分析研讨班

日期

主题

授课内容

第一天上午

PacBio测序技术介绍

高通量测序技术发展、机遇及挑战

PacBio测序技术、平台及原理介绍

三代测序应用中样本提取和建库流程

PacBio测序(RSII和Sequel)的样本提取、质检及建库流程等

第一天下午

BioNano及HiC相关实验流程

BioNano光学图谱的样本提取、质检及建库流程等

HiC文库的样本提取、质检及建库流程等

第二天上午

Linux系统基本操作

Linux系统简介

Linux基础操作

常用Linux命令学习与实践

第二天下午

PacBio测序在动植物基因组中研究应用

基于PacBio的动植物基因组文章深度解读

基于PacBio动植物基因组组装注释流程

常用基因组组装软件(如FACLON,PBJelly等)原理介绍

常用基因组注释方法介绍

基于PacBio动植物基因组组装的实例演示

(可选200M左右简单基因组进行实操,分别用FACLON和PBJelly组装注释)

第三天上午

PacBio测序在全长转录组中研究应用

基于PacBio全长转录组文章深度解读

基于PacBio全长转录组分析流程

常用软件原理介绍

基于PacBio全长转录组分析实例演示

(可选1个Sequel SMRT Cell数据量进行全长转录本分类、聚类与校正)

第三天下午

PacBio测序在动植物基因组甲基化研究应用

基于PacBio全基因组甲基化分析流程

常用软件原理介绍

基于PacBio全基因组甲基化分析实例演示

(可选基因组中200M左右简单基因组数据进行实操)

PacBio测序在微生物基因组研究应用

1.   微生物基因组概述                       
  2. 基于PacBio 微生物基因组分析流程
  3. 常用软件(如HGAP等)原理介绍
  4. 常用数据库介绍(Go,KEGG,CAzy等)
  5. 基于PacBio微生物基因组组装的实例演示


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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