近年来，随着高通量测序技术的迅猛发展，转录组研究从以前的微阵列技术，SAGE及MPSS技术的低通量模式切换至RNA-seq的高通量模式。转录组学作为一个伴随高通量测序技术率先发展起来的技术开始在生物学前沿研究中得到了广泛的应用。RNA-seq对于真核生物的基因表达调控，癌症等疾病的发生机制和新治疗方案确定，遗传育种等众多方面的研究具有不可估量的潜力。为了辅助广大科研工作者掌握转录组高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能，举办“转录组学”专题实战班。欢迎报名参加。
主办单位：北京市计算中心有限公司
协办单位：
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
工业和信息化人才培养工程培训基地
北京市大数据教学实践基地
举 办 地：北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程安排：2023年11月27-29日（周三-周五） 上9:30-11:30 下13:30-17:00
日期 | 主题 | 内容 | 备注 |
第一天 | 转录组学前沿概述及测序原理 | 1.转录组技术发展前沿动态 2.转录组应用案例及应用热点 3.常用的转录组实验设计及测序建库技术 4.单细胞转录组测序技术 5.转录组技术流程及技术细节 | 理论 |
Linux服务器使用入门 | 1.掌握Linux系统下的常用命令（重点讲解） 2.掌握Linux环境下软件的安装使用 3.了解Shell脚本的编写 | 上机操作 | |
第二天 | 转录组分析方法 | 1.差异表达基因的功能分析（重点讲解） | 理论 |
De novo转录组数据分析上机实践 | 1.原始测序数据的检测和预处理（重点讲解） 2.使用Trinity拼接转录组数据（重点讲解） 3.原始数据与拼接转录本的比对（重点讲解） 4.表达量统计和差异表达分析（重点讲解） 5.使用blast对转录本进行功能注释（重点讲解） 6.寻找转录本的ORF，翻译蛋白质序列 7.转录因子注释 | 上机操作 | |
Reference based转录组数据分析 上机实践（一） | 1.转录组数据准备和软件介绍 2.使用HISAT进行转录组数据的比对（重点讲解） 3.用IGV查看比对结果 4.使用cufflinks进行表达量估计和分析（重点讲解） 5.使用samtools检测转录组数据中的突变（重点讲解） | 上机操作 | |
第三天 | Reference based转录组数据分析 | 1.lncRNA的定义、应用和发展 2.lncRNA的生物学过程 3.lncRNA研究的实验设计及测序原理 4.lncRNA测序分析结果解读 | 理论 |
Reference based转录组数据分析 上机实践（二） | 1.利用tophat和cufflinks组合，预测转录本 2.使用CNCI预测新的lncRNA转录本（重点讲解） 3.使用LncTar软件预测lncRNA调控的靶基因（重点讲解） | 理论+ 上机操作 | |
microRNA测序与数据分析 | 1.microRNA的定义、应用和发展 2.microRNA的生物学过程 3.microRNA研究的实验设计及测序原理 | 理论 | |
microRNA测序与数据分析（包含上机实践） | 1.microRNA测序数据分析软件（重点讲解） 2.microRNA测序数据预处理（重点讲解） 3.microRNA的预测（重点讲解） 4.microRNA靶标基因预测，结果提取、统计（重点讲解） | 理论+ 上机操作 |
注：内容以实际发生为准；若调，会提前通知。
【报名费用】
注册费：4200元/人（含当期听课费、资料费、证书费、考试费（如有））。
提供当期视频回放以供复习使用（羽林学院平台）。
开具增值税发票，提供盖章通知、结业证书等相关材料。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元；
2、4+1团报，可免费赠送一个名额；
3、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种；
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
【咨询请联系】
QQ号：3498448850
邮箱：bcc_peixun@163.com
张老师 18618295767（微信同号）
郭老师 18976866894
【注】开课前一周会发送邮件通知；若未接到邮件通知，请电话咨询。
