日期 | 时间 | 课程名称 | 课程内容 |
第一天 上午 | 09:30- 10:30 | 生物信息学概述与前沿 | 1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍 2. 生物信息进展与前沿技术介绍 |
10:30-12:00 | NCBI数据库 | NCBI数据库介绍:PubMed、Nucleotide(GenBank)、Genome、Structures(MMDB)、Taxonomy、UniGene、Entrez等,数据查询检索 | |
第一天 下午 | 13:30-15:00 | NCBI数据库 | 2. NCBI数据库数据上传提交与批量下载 3. NCBI数据库实例讲解与练习 |
15:00-17:00 | Blast与序列比对 | 1. Blast与序列检索比对及参数 2. Blast建库与Blast本地化 3. 实例讲解与练习 | |
第二天 上午 | 09:30-12:00 | MEGA软件与分子进化 | 1. 分子进化理论基础 2. MEGA与系统发育树构建 3. 实例讲解与练习 |
第二天 下午 | 13:30-17:00 | 分子网络与生物学通路分析 | 1. 分子相互作用数据库与通路概述(Uniprot,String,DIP数据库) 2. 分子网络分析工具Cytoscape及插件使用 3. 实例讲解与练习 |
第三天 上午 | 09:30-12:00 | 基因组注释 | 1. 基因本体数据库GO及GO注释 2. 生物学通路KEGG注释方法与实现 3. David与基因注释 4. IPA简介,查询搜索,通路分析与网络构建 |
第三天 下午 | 13:30-15:30 | 疾病和基因突变数据库 | 1. GeneCard数据库介绍及使用 2. HGMD(人类基因突变数据库)数据库介绍及使用 |
15:30-17:00 | 药物基因组数据库 | 1. PharmGKB数据库介绍及使用 2. PGMD数据库介绍及使用 | |
第四天 上午 | 09:30-12:00 | 表观遗传学 | 1. Encode数据库介绍及使用 2. Roadmap数据库介绍及使用 3. RegulomeDB数据库介绍及使用 |
第四天 下午 | 13:30-15:30 | 蛋白质3D结构 | 1. 蛋白质结构分析概述 2. PDB数据库介绍与使用 3. PyMol蛋白质结构分析软件介绍与使用 |
15:30-17:00 | SPSS软件与生物统计应用 | 1. 生物统计概述 2. SPSS使用与生物统计应用 3. 实例讲解与练习 |