基因组遗传变异与数据分析实用技术培训

日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

上午

生物信息学概述及NGS原理与应用

1.    生物信息学知识背景概述;

2.    二代测序(NGS)的基本概况和技术发展简介;

3.    NGS建库原理与技术;

下午

Linux上机操作及生物信息学软件安装及使用 (上机操作)

1.    linux基础与基本操作;

2.    生物信息学软件应用及常用软件介绍;

3.    重测序相关分析软件介绍及安装;

第二天

上午

基因组重测序技术应用理论与策略

1.    基因组重测序的理论与研究方法及意义;

2.    全基因组数据分析策略;

3.    全外显子数据分析方法与应用;

4.    目标区域测序的策略应用与技术前沿应用;

下午

基因组变异分析 (上机操作)

1.    重测序的分析流程;

2.    原始测序数据的质控及过滤;

3.    学习BWAsamtools等工具的使用,进行calling SNP,INDEL

4.    sam/bam文件处理、VCF文件与基因组变异位点分析

第三天

上午

基因组变异分析 (上机操作)

1.    利用重测序数据检测拷贝数变异(CNV);

2.    利用重测序数据检测易位、转置等结构变异(SV

下午

基因组变异注释与功能分析

(上机操作)

1.    基因组注释工具Annovar的应用;

2.    功能分析工具David的使用;

3.    基因组变异数据库GenecardHGMD等以及功能分析的应用;

4.    药物基因组学与靶向药突变位点查询;

5.    基因组变异位点筛选与过滤分析


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

主页链接

js