日期
时间
授课题目
授课内容
第一天
上午
SRA数据库介绍及使用
1、数据挖掘概述; 2、高通量组学研究基础知识; 3、SRA数据库在线工具的应用; 4、SRA数据上传与下载
下午
GEO数据库介绍及使用
1、GEO在线工具的应用; 2、GEO数据下载和数据质量分析; 3、GEO芯片数据处理
第二天
TCGA数据库介绍及使用
1、TCGA数据库基本概念介绍及数据获取 2、操作实战: TCGA数据获取,不同类型数据的使用 3、基于TCGA和GEO数据挖掘文章的深度解析及复现(结合具体实例);
TCGA及生物网络调控分析
1、基因表达谱的PPI网络挖掘 2、利用cytoscape进行miRNA-mRNA互作网络、蛋白质-蛋白质互作网络上机操作
(课程内容以实际授课为准)