生物信息学Python语言培训通知


日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

09:30-10:30

Python概述及其在生物信息领域的应用

概括介绍Python语言的概念及特点,及其在生物信息领域的应用

10:30-12:00

Python软件安装、运行与基本操作

PythoniPython的安装及使用,Python程序的运行;DOSUnix命令行操作基本命令;Python变量定义、数字及基本运算

13:30-15:00

核心数据类型(1

列表、元组

15:00-16:00

基本语法结构

判断结构、循环结构、异常处理

16:00-17:00

实例练习

使用python编程,生成斐波那契数字序列

第二天

09:30-11:00

核心数据类型(2

字符串、字典

11:00-13:00

文件与文件夹操作

文件的读入与写入、文件夹操作

13:30-17:00

实例练习

FASTA文件的处理:1、序列基本信息的统计(序列数、碱基数、及平均长度);2fasta序列反向互补转换和切割

第三天

09:30-11:00

函数和模块

系统库函数、第三方函数、自定义函数;模块定义、导入、使用

11:00-12:00

正则表达式

Python特色功能正则表达式学习与应用

13:30-14:30

实例练习

系统命令在python中的调用

14:30-17:00

实例练习

大数据文件的分割及合并

第四天

09:30-11:00

BioPython简介及应用实例

BioPython安装及学习,生物信息学中的实际应用

11:00-12:00

BioPython快速应用

使用BioPython处理传统的生物信息数据

15:00-17:00

实例练习

应用biopython实现genbankuniprot格式数据转换为fasta格式。
 
应用biopythonblast   xml结果文件中提取目的信息。


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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