实用微生物组学信息分析精品班通知

日期

上课时间

授课题目

授课内容

第一天

9:30-12:00

微生物组学研究概论及进展

1、微生物组研究的发展历史

2、微生物测序分析技术及实验技术原理

3、研究热点分享

13:30-17:00

经典案例分享和方案设计与文章架构设计

1、微生物组学经典文章回顾,未来微生物组学发展方向

2、已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案

3、文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧

第二天

9:30-12:00

Linux基础操作

1、Linux常用命令使用和上机操作

2、Linux环境下软件安装

16s测序分析结果解读

1、OUT分析

2、物种分类与丰度分析

3、Alpha多样性分析

4、Beta多样性分析

5、显著性差异分析

13:30-17:00

16s数据分析

(上机)

1、质控与数据拼接

2、OTU聚类

3、物种注释

4、统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。

第三天

9:30-12:00

宏基因组测序分析结果解读

1、物种注释分析

2、差异物种分析

3、差异基因分析

4、功能注释分析

5、MGS分析

13:30-17:00

宏基因组数据分析(上机)

1、质控

2、拼接组装

3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等

4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等

5、功能注释:RAMMCAP;Blast等

6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)比较分析

第四天

9:30-12:00

R的数据处理功能及统计应用

1、R的安装、运行与使用

2、R语法介绍(R基本符号)

3、R数据处理,对R语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围

13:30-17:00

R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用

1、基础绘图工具(绘图函数、参数、画图面板分割及图形的保存)

2、微生物组学数据结果制作案例实际操作

 


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

主页链接

js