日期 | 上课时间 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 9:30-10:30 | 基因组学及生物信息学概述 | 1、基因组学与生物信息学背景知识介绍 2、生物信息进展与前沿技术介绍 |
10:40-12:00 | 组学技术介绍 | 基因组学，转录组学，表观组学，蛋白质组学，代谢组学及相关技术介绍 | |
13:30-17:00 | 基因组学实验设计及数据分析 | 1、基因组重测序的理论与研究方法及意义 2、全基因组数据分析策略 3、全外显子组、目标区域测序策略与分析 4、经典文章解读与研究方案设计 | |
第二天 | 9:30-12:00 | 转录组学实验设计及数据分析思路 | 1、转录组学研究的实验技术和分析基础 2、有reference转录组数据分析思路 3、无reference转录组数据分析思路 4、经典文章解读与研究方案设计 5、转录组数据分析上机练习 |
13:30-17:00 | 表观组学——DNA甲基化和RNA的联合分析 | 1、高通量表观遗传组学数据原理 2、DNA甲基化数据分析方法 3、DNA甲基化与转录组联合分析思路 4、零编程复现生物信息文章套路 | |
表观组学——公共数据库及工具介绍 | 1、 Chip-seq数据分析方法 2、表观组学公共数据库介绍 | ||
第三天 | 9:30-12:00 | 蛋白质组学实验设计及数据分析 | 1、蛋白质组数据的鉴定和质量控制 2、蛋白质谱搜库 3、蛋白质组数据分析：同源映射（Blast）及蛋白ID转换，GO富集分析，Pathway分析 4、蛋白互作(PPI)分析、功能作图及模型构建 5、经典文章解读与研究方案设计 |
13:30-17:00 | 蛋白组和代谢组在分子机制解析及标志物发掘中的应用 | 1、蛋白组和代谢组技术策略解析 2、多层组学整合思路探讨及研究案例讲解 3、根据参考案例文章，应用免费软件完成发表级别图表绘制 | |
第四天 | 9:30-12:00 | 多组学数据整合分析思路介绍 | 1、基因组和转录组数据整合分析思路介绍： 1）基因组和转录组数据整合分析 2）RNA-RNA联合分析 3）组学数据与临床数据关联分析 4）基于多组学数据的分子分型 5）基于多组学数据的biomarker发现 2、基因组和转录组数据整合分析案例介绍 |
13:30-17:00 | 多组学数据分析实例演练 | 1、 甲基化与表达谱关联分析 2、 miRNA的mRNA靶基因分析 3、 miRNA的lncRNA靶基因分析 4、 ceRNA网络构建 5、 多组学与临床数据整合分析 6、 多组学整合分析在线数据库 |
