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基于NGS的肿瘤精准医学研究基础培训班

日期

时间

课程名称

课程内容

备注

第一天

9:30-12:00

肿瘤精准医学概述

1、肿瘤基因组特点

2、肿瘤精准医学研究现状及挑战

理论

13:30-17:00

高性能计算平台介绍

1、高性能计算机概述

2Linux操作系统简介

3Linux命令与操作基础

上机

第二天

9:30-12:00

重测序技术在肿瘤研究中的应用

1、重测序技术理论介绍

2、重测序数据分析基本流程

理论

+上机

13:30-17:00

1、肿瘤体细胞变异的鉴定及功能注释

2、肿瘤重要驱动基因的鉴定及案例分享

理论

+上机

第三天

9:30-12:00

转录组测序技术在肿瘤研究中的应用

1、转录组测序理论介绍

2、转录组测序在肿瘤研究中的应用及案例分享

理论

13:30-17:00

1、基因表达量估计及差异表达基因分析

2、基因注释

上机

第四天

9:30-12:00

肿瘤研究中的统计分析

1、肿瘤样本生存分析方法与实践

2、基因组变异与临床数据关联分析

3、基因表达与临床数据关联分析

理论

+上机

13:30-17:00

利用肿瘤生物信息数据库进行数据挖掘、文章发表案例

1NCBI数据库介绍及应用

2TCGA数据库介绍及应用

3cosmic数据库介绍及应用

4、利用公共数据库发表文章案例解析

理论

+上机