日期 | 主题 | 授课内容 |
第一天上午 | PacBio测序技术介绍 | 高通量测序技术发展、机遇及挑战 PacBio测序技术、平台及原理介绍 |
三代测序应用中样本提取和建库流程 | PacBio测序(RSII和Sequel)的样本提取、质检及建库流程等 | |
第一天下午 | BioNano及HiC相关实验流程 | BioNano光学图谱的样本提取、质检及建库流程等 HiC文库的样本提取、质检及建库流程等 |
第二天上午 | Linux系统基本操作 | Linux系统简介 Linux基础操作 常用Linux命令学习与实践 |
第二天下午 | PacBio测序在动植物基因组中研究应用 | 基于PacBio的动植物基因组文章深度解读 |
基于PacBio动植物基因组组装注释流程 常用基因组组装软件(如FACLON,PBJelly等)原理介绍 常用基因组注释方法介绍 基于PacBio动植物基因组组装的实例演示 (可选200M左右简单基因组进行实操,分别用FACLON和PBJelly组装注释) | ||
第三天上午 | PacBio测序在全长转录组中研究应用 | 基于PacBio全长转录组文章深度解读 |
基于PacBio全长转录组分析流程 常用软件原理介绍 基于PacBio全长转录组分析实例演示 (可选1个Sequel SMRT Cell数据量进行全长转录本分类、聚类与校正) | ||
第三天下午 | PacBio测序在动植物基因组甲基化研究应用 | 基于PacBio全基因组甲基化分析流程 常用软件原理介绍 基于PacBio全基因组甲基化分析实例演示 (可选基因组中200M左右简单基因组数据进行实操) |
PacBio测序在微生物基因组研究应用 | 1. 微生物基因组概述 |