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10x Genomics单细胞转录组测序及多组学数据挖掘技术培训班.


主题

简介

第一天 (理论+实操)

10X Genomics 单细胞转录组测序技术、单细胞悬浮液或原生质体制备技术

·         基因组、生物信息学相关的背景概述

·         10X   Genomics 单细胞转录组测序技术简介

·         单细胞悬浮液或原生质体制备技术

·         上机操作基础(R语言实操、Linux服务器架构及基本操作)


第二天(理论+实操)

单细胞转录组测序技术分析流程(常规分析及高级分析流程介绍及深度解析)

·         Cell   ranger 质控

·         T-SNE聚类

·         如何确定细胞类群

·         如何寻找bio-marker

·         如何优化分析流程


第三天 (理论+实操)

多组学数据深度挖掘、结果展示技巧及高分SCI论文整理思路

 

·         多组学研究思路

·         多种作图方式结合

(综合利用R、PPT等绘图工具拼接完成论文图片)

·         高分辨率SCI论文图片生成

·         (综合利用AI、pdfviewer生成高质量论文图片)

·         数据重复性评估

(如何在文中体现出不同重复的RNA-SEQ结果、Realtime PCR结果与RNA-SEQ结果如何对用)

·         基因共表达网络构建与Cytoscape展示

·         多组数据表达趋势聚类及深度解析策略