多组学数据分析及挖掘培训班

第一天

9:30-10:30

基因组学及生物信息学概述

1、基因组学与生物信息学背景知识介绍； 
  2、生物信息进展与前沿技术介绍；

10:40-12:00

组学技术介绍

基因组学，转录组学，表观组学，蛋白质组学，代谢组学及相关技术介绍；

13:30-17:30

基因组学实验设计及数据分析

1、基因组重测序的理论与研究方法及意义； 
  2、全基因组数据分析策略； 
  3、全外显子组、目标区域测序策略与分析 
  4、经典文章解读与研究方案设计

第二天

9:30-12:00

转录组学实验设计及数据分析

1、转录组学研究的实验技术和分析基础； 
  2、有referecnce转录组数据分析； 
  3、无reference转录组数据分析； 
  4、转录组高级数据分析（聚类、网络构建等）； 
  5、经典文章解读与研究方案设计

13:30-17:30

表观组学实验设计及数据分析

1、表观遗传学实验数据的分析方法； 
  2、DNA甲基化数据分析； 
  3、蛋白质与DNA相互作用研究； 
  4、经典文章解读与研究方案设计

第三天

9:30-12:00

蛋白质组学实验设计及数据分析

1、蛋白质组数据的鉴定和质量控制； 
  2、蛋白质谱搜库； 
  3、蛋白质组数据分析：同源映射（Blast）及蛋白ID转换，GO富集分析，Pathway分析； 
  4、蛋白互作(PPI)分析、功能作图及模型构建； 
  5、经典文章解读与研究方案设计

13:30-17:30

基因组和转录组整合分析思路及研究案例讲解

1、DNA层面筛选的候选基因在转录水平的展示； 
  2、RNA层面显著差异表达基因在基因组突变的分析； 
  3、关键基因的通路富集分析等；

第四天

9:30-12:00

lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练及研究案例讲解

1、差异表达lncRNA靶基因与差异表达mRNA共有基因分析； 
  2、差异circRNA来源基因与差异 mRNA共有基因分析； 
  3、差异 miRNA靶基因与差异 mRNA共有基因分析； 
  4、lncRNA-miRNA-mRNA联合分析； 
  5、circRNA-miRNA-mRNA联合分析； 
  6、ceRNA网络构建

13:30-15:30

DNA甲基化和RNA的联合分析

1、   DMR（差异甲基化修饰区域）相关基因与mRNA联合分析； 
  2、 DMP（差异甲基化修饰启动子）相关基因与mRNA联合分析；

15:40-17:30

蛋白组和代谢组在分子机制解析及标志物发掘中的应用

1、蛋白组和代谢组技术策略解析； 
  2、多层组学整合思路探讨及研究案例讲解； 
  3、根据参考案例文章，应用免费软件完成发表级别图表绘制