基因组关联分析技术应用培训班


随着测序技术的发展,产生了海量的基因型数据,然而如何将基因型与表型进行关联,从而定位复杂疾病风险基因或农业动植物重要经济性状相关的遗传变异却是一项巨大挑战。在过去的十年间,借助全基因组关联分析(GWAS),科研人员发掘了大量与人类复杂疾病和农业动植物重要经济性状相关的遗传变异。

北京市计算中心生物计算事业部,在基因组关联分析领域具有丰富经验,发表多篇领域顶级杂志。针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的生物医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。

培训特色:

无需任何计算机语言基础;

深入浅出,内容精要实用;

结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授;

统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用;

授课老师经验丰富,边学边练,重实践,力求实效;

小班授课,个别辅导。

主办单位:北京市计算中心

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地

北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地

 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:2020年12月2-4日 上午9:30-11:30   下午13:30-17:00

日期

授课题目

授课内容

备注

第一天

基因组关联分析理论基础

1、基因组学与生物信息学概述

2、基于群体遗传的数据获取

3、基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍

4、常用GWAS数据库介绍

理论+

操作(上机)

GWAS计算机基础

1、Linux基础for GWAS

2、R基础for GWAS

Plink软件基础应用

1、Plink软件应用

2、Plink文件格式生成与解析

3、等位基因频率计算

4、哈-温平衡计算

5、基因组关联分析流程

6、关联分析结果分析与p校正

第二天

基因型填充Imputation

1、基因型填充Imputation的原理及应用

2、基因型填充软件介绍与应用

3、基因组填充的方法与分析流程

4、1000G数据应用

理论+

操作(上机)

关联分析应用

1、基于家系的关联分析

2、曼哈顿图的绘制与结果展示

3、实操for Plink

理论+

操作(上机)

第三天

关联分析应用

1、单倍型介绍

2、单倍型分析

3、LD连锁不平衡指数计算

4、实操

5、Tassel软件介绍

理论+

操作(上机)

注:课程以实际发生为准;若调,会提前通知。

报名费用

注册费:4200元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。培训期间,免费提供工作午餐。

提供当期直播回放(北京市计算中心羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

注:凡9月开学季报名缴费者有机会获赠价值186元《高通量测序与高性能计算理论和实践》书籍一本。限量50本,先到先得。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款、现场刷卡

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

咨询请联系

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881

开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。

 


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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