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生物大数据时代的网络药理学研究模式学习班


 

人工智能以及云计算技术的快速发展,精准医学与医学大数据在生命科学领域的作用越来越明显。在人工智能的潮流中,中医药也迎来了新的发展契机。网络药理学是人工智能和大数据时代药物系统性研究的新兴、交叉、前沿学科,强调从系统层次和生物网络的整体角度出发,解析药物及治疗对象之间的分子关联规律,被广泛应用于药物和中药活性化合物发现、整体作用机制阐释、药物组合和方剂配伍规律解析等方面,为中药复杂体系研究提供了新思路,为临床合理用药、新药研发等提供了新的科技支撑。

在大数据背景下,随着网络药理学的影响力和应用日益广泛,网络药理学在理论分析、算法发展和实际应用等方面,面临着重要的发展机遇和挑战。整合临床、实验的海量数据,结合科学验证,揭示药物对疾病的调控机制,是网络药理学研究的主要任务。

 

中医药是中华民族的宝贵财富,在疾病防治方面具有独特的优势。中医整体观与以网络和系统为特征的新一代医学研究范式相吻合。中医提出了一种全新的“网络靶标”方法,即网络药理学的核心理论和方法。中医也是网络药理学的一个重要研究对象。中医网络药理学,旨在了解复杂疾病、中医证候和中药治疗的网络生物学基础,在网络药理学的起源和发展过程中起着至关重要的作用。

 

为更好地了解网络药理学的新进展,包括预测中药靶标,了解疾病和证候的生物学基础,中药方剂的网络调控机制,以及基于生物网络的疾病和证候标志物的识别。这些研究呈现出计算、实验和临床相结合的趋势,是未来中药网络药理学研究的一个很有前途的方向。我中心智能计算事业部特举办“生物大数据时代的网络药理学研究模式研讨班”。培训班由我中心的一线分析工程师授课,通过技术讲座结合实验操作,展示应用实例,现场解答技术疑问,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平和竞争力。

授课对象:生物信息学学员,高校生物、药学相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员

电脑要求:64位windows10操作系统,运行日常程序流畅。

主办单位:北京市计算中心有限公司

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

工业和信息化人才培养工程培训基地

北京市大数据教学实践基地

举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排:2023年2月22-24日(周三--周五) 上9:30-11:30 下13:30-17:00

日期

主题

内容

备注

第一天

主题1:网络药理学研究思路

1、网络药理学的发展历程和研究现状简介

2、网络药理学SCI论文研读分析

3、网络药理学的研究思路及技术路线

理论

主题2:中药有效成分查找和获取

4、中药有效成分及靶点查找和获取

1)常用中药数据及使用:TCMSP

2)中药高通量实验和参考数据库:Herb

3)中医药证候关联数据库:SymMap

4)中医药百科全书数据库:ETCM

5、中药有效成分靶点预测的查询及获取

1)化合物与蛋白质互作:STITCH

2)中药有效成分靶点的预测:SwissTargetPrediction

3)基于有效成分结构特征靶点预测:PharmMapper

4)中药有效成分靶点的获取:反向虚拟筛选方法

6、中药分子机制研究的在线生物信息学分析工具: BATMAN-TCM

理论+

实战

第二天

主题3:疾病相关基因的获取

7、中药所治疗疾病的相关基因查找和获取

1)人类疾病与基因遗传变异数据库:OMIM

2)疾病相关的基因与突变位点数据库:DisGeNet

3)人类基因数据库:Genecards

4)治疗靶标数据库:TTD

理论+

实战

主题4:网络药理学数据整理及分析

8、韦恩图的绘制

9、蛋白质互作网络查询和可视化分析:STRING

10、富集分析数据库:DAVID

11、Metascape功能富集分析和信号通路富集分析

12、富集GO term BP,CC,MF三合一柱状图绘制

13、通路气泡图的绘制

理论+

实战

第三天

主题5:网络药理学数据可视化

14、网络分析软件:Cytoscape

1)分析数据导入与导出

2)基本拓扑特征计算

3)重要节点识别

4)网络拓扑指标含义

5)子网络提取

6)网络可视化

7)图形导出

8)Cytoscape插件的安装和使用

15、蛋白结构数据库及结构数据的筛选和获取:PDB、Uniport

16、小分子化合物结构信息查询:Pubchem、Drugbank

17、分子对接

1)对接软件的介绍及安装

2)小分子和蛋白结构文件的预处理

3)蛋白活性位点的确定

4)分子对接流程的介绍及实战

5)分子对接结果相互作用分析及可视化

理论+

实战

注:内容以实际发生为准;若调,会提前通知。

【报名费用】

注册费:4200元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。

提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

【报名优惠政策】

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

【付费方式】

手机银行或电子银行转账、银行汇款等

单位全称:北京市计算中心有限公司

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京自贸试验区永丰基地支行

(汇款信息备注:“智能计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。

【咨询请联系】

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881

【注】开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。