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实用生物信息学研讨班

生物信息学是一门新兴的交叉学科,它的出现和发展,与生物技术的迅速发展密不可分。生物信息学可以帮助我们理解生命科学领域中的大量数据,包括基因、基因组、蛋白质、代谢等多个层面的信息。掌握生物信息学的相关知识和技能,可以帮助我们更好地理解和解释生物医学数据,并为生命科学研究提供重要支持。

本期实用生物信息学研讨班是一个系统、全面的培训课程,旨在帮助生物医学研究者和生物信息学初学者全面掌握生物信息学相关的知识和技能,包括生物信息学和各组学知识以及多类测序数据的实例分析等。如有更多关注信息或是科研难点问题,可与授课老师进行互动讨论。

主办单位:北京市计算中心有限公司

协办单位:

北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

云计算关键技术与应用北京市重点实验室

工业和信息化人才培养工程培训基地

北京市大数据教学实践基地

举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排2024415-19日(周一—周五)  上9:30-12:00  下13:30-17:00

日期

主题

内容

备注

第一天

组学及生物信息学概述

1、组学研究概述(基因组学、转录组学、表观组学、蛋白质组学、代谢组学及相关技术介绍)

2、实验设计及测序原理

3、生物信息学背景知识介绍

理论

Linux服务器使用入门

1、掌握Linux系统下的常用命令(重点讲解)

2、掌握Linux环境下软件的安装使用

3、了解Shell脚本的编写

实战

R语言入门

1、R语言简介

2、R语言安装及配置

3、R语言数据结构

4、R语言数据处理

5、R语言绘图

理论+

实战

第二天

转录组数据分析

1、转录组技术发展前沿动态

2、转录组应用案例及应用热点

3、常用的转录组实验设计及测序建库技术

4、转录组分析方法介绍

理论

转录组数据分析实例(上机操作)

1、转录组数据准备和软件介绍及安装

2、转录组数据的比对(重点讲解)

3、表达量估计和分析(重点讲解)

理论+

实战

第三天

基因组重测序与数据分析

1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用

2、结合实例讲解其原理、数据类型与格式、操作流程、软件等相关知识

理论

基因组重测序数据分析实例(上机操作)

1、对二代测序数据的解读

2、数据质量控制及数据过滤

3、使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化(重点讲解)

4、寻找SNP和Indel并进行注释(重点讲解)

5、寻找结构变异并对变异进行注释(重点讲解)

理论+

实战

第四天

microRNA测序与数据分析

1、microRNA的定义、应用和发展

2、microRNA的生物学过程

3、microRNA研究的实验设计及测序原理

4、microRNA测序数据分析软件(重点讲解)

5、microRNA目前的挑战以及将来的研究前景

6、microRNA测序数据分析案例展示(重点讲解)

7、近期文献

理论

microRNA数据分析实例(上机操作)

1、microRNA测序数据预处理(重点讲解)

2、测序数据长度分布计算

3、microRNA的预测(重点讲解)

4、microRNA碱基偏好性计算

5、microRNA靶标基因预测,结果提取、统计(重点讲解)

理论+

实战

第五天

10×单细胞转录组测序数据分析原理

1、单细胞测序技术研究现状及应用

2、单细胞转录组实验设计及建库测序原理(重点介绍10× Genomics)

3、空间转录组实验设计及建库测序原理

理论

10×单细胞转录组测序数据分析流程上机操作

1、10×单细胞软件Cellranger处理测序原始数据实战

2、R包Seurat细胞分群、umap、t-sne、marker基因筛选实战

实战

蛋白结构与互作分析

1、PyMOL

2、Cytoscape

实战

注:内容以实际发生为准;若调,会提前通知。

报名费用

注册费:5400元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。

提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

【咨询请联系】

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

郭老师 18976866894

【注】开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。