分子模拟与蛋白互作研习班


 
日期

时间

课程名称

课程内容

第一天

09:30-11:00

生物分子互作简介

1. 生物分子互作原理 
  2. 生物分子互作研究方法介绍

11:00-12:00

蛋白质数据库

1. RCSB PDB数据库介绍及使用 
  2. RCSB PDB数据库的使用 
  3. PDB文件格式详解

午餐、午休

13:30-15:00

蛋白结构分析

1. 分子互作可视化软件Pymol、Chimera介绍 
  2. Pymol软件使用 
  3. Chimera软件使用

15:00-17:00

同源建模 
  Homology modeling

1. 同源建模原理介绍 
  2. Swiss-model在线同源建模 
  3. 实例讲解与练习

核酸三维结构获取

1. 核酸结构理化性质概论 
  2. Chimera等软件核酸结构构建

化学小分子结构获取

1. ChemDraw等化学专业构图软件介绍 
  2. ChemDraw实例应用

第二天

09:30-12:00

分子对接 
  Molecular docking

1. 分子对接理论介绍 
  2. 分子对接软件Autodock、Vina等软件介绍 
  2. 分子对接软件(Autodock)的使用 
  3. 实例讲解与练习

午餐、午休

13:30-15:30

蛋白质-蛋白质对接

1. 大分子对接现状分析 
  2. 软件Rosetta软件介绍与使用 
  2. 软件z-dock软件介绍与使用 
  3. 实例讲解与练习

蛋白质-核酸对接

15:30-14:00

虚拟筛选 
  Virtual Screening

1. 计算机辅助虚拟筛选介绍 
  2. ZINC等小分子数据库介绍与应用 
  2. Autodock vina介绍及使用 
  3. 1000体系数据库虚拟筛选实例与练习

第三天

09:30-12:00

药物先导化合物设计与改造

1. 结构上阐述:药物耐药性机理 
  2. 以雌激素受体为例,在生物和化学基础上阐述药物改造机制 
  3. 相关问题答疑;

午餐、午休

13:30-16:00

文章作图 
  实例操作

1. 挑选最新Cell、Nature、Science、PNAS等高端杂志论文,进行生物计算论文思路阐述; 
  2. 挑选Cell、Nature、Science、PNAS等杂志中图形、表格,实例操作

16:00~17:00

听课老师们在做项目探讨解疑


培训咨询方式

Q   Q:  3498448850
Email:  bcc_peixun@163.com
张老师:  18618295767(微信同号)
于老师:  15621925881

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