细胞图谱构建、细胞亚群分析、稀有细胞类型鉴定、肿瘤微环境、肿瘤耐药性…,单细胞转录组测序技术已成为近几年非常热门的话题之一。同时,转录组学数据泛滥的时代,如何才能找到数据中的亮点?如何深度挖掘数据中隐藏的创新点,让科研工作者掌握几种深度解析组学数据的方法?本课程一共3天,理论与实战相结合。培训内容包括单细胞制备技术、单细胞转录组分析标准流程、差异基因分析、功能富集分析、流程优化、常规转录组测序数据分析、多组学数据整合挖掘分析、SCI论文图表整理。
主讲专家来自重点高校及科研院所一线科研人员,长期从事生物数据分析与挖掘,基因测序等领域研究工作,以第一作者发表过多篇生物学一区、二区TOP SCI论文(如:Plos Genetics;Plant Cell等)。精通python语言、R语言等分析工具,具有丰富的科研及高通量测序数据分析与挖掘经验,培训学员近2000人。
主办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
举办地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程安排:
2020年3月19-21日上午:9:30-11:30下午:13:30-17:00
时间 | 主 题 | 简 介 |
第一天(理论+实操) | 10X Genomics单细胞转录组测序技术、单细胞悬浮液或原生质体制备技术 | > 基因组、生物信息学相关的背景概述 > 10X Genomics单细胞转录组测序技术简介 > 单细胞悬浮液或原生质体制备技术 > 上机操作基础(R语言实操、Linux服务器架构及基本操作) |
第二天(理论+实操) | 单细胞转录组测序技术分析流程(常规分析及高级分析流程介绍及深度解析) | > Cell ranger 质控 > T-SNE聚类 > 如何确定细胞类群 > 如何寻找bio-marker > 如何优化分析流程 |
第三天(理论+实操) | 多组学数据深度挖掘、结果展示技巧及高分SCI论文整理思路 | > 多组学研究思路 > 多种作图方式结合 (综合利用R、PPT等绘图工具拼接完成论文图片) > 高分辨率SCI论文图片生成 (综合利用AI、pdfviewer生成高质量论文图片) > 数据重复性评估 (如何在文中体现出不同重复的RNA-SEQ结果、RealtimePCR结果) > 基因共表达网络构建与Cytoscape展示 > 多组数据表达趋势聚类及深度解析策略 |
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
(课程内容以实际授课为准)
【收费标准】
注册费:3900元/人,包括学费、资料费、上机费。培训期间,免费提供工作午餐。
【报名优惠政策】
1、 2020.3.5之前报名并缴费的学员每人可减少200元;
2、 3人以上团体报名每人可减少300元;
3、 4+1团报,可免费赠送一个名额;
4、 上面几种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
老学员参加及老学员推荐参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【付费方式】
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账 号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(备注:在汇款明细里加上“生物计算事业部——您的姓名”)
【注】开课前一周会发送邮件通知,若未接到邮件通知,请电话咨询。
【咨询请联系】
QQ号:3498448850
张老师:18618295767(微信同号),bcc_peixun@163.com